More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0176 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  46.47 
 
 		 839 aa  753    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  100 
 
 		 835 aa  1720    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.33 
 
 		 847 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  35.34 
 
 		 783 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  35.1 
 
 		 783 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  35.39 
 
 		 838 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  35.74 
 
 		 848 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  36.06 
 
 		 835 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  36.08 
 
 		 836 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  34.21 
 
 		 886 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  34.97 
 
 		 862 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  33.18 
 
 		 817 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  35.14 
 
 		 810 aa  438  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  34.6 
 
 		 783 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  44.09 
 
 		 872 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.72 
 
 		 837 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  33.9 
 
 		 828 aa  389  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  31.11 
 
 		 835 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  31.65 
 
 		 823 aa  376  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  32.04 
 
 		 835 aa  363  6e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  32.82 
 
 		 767 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  31.76 
 
 		 825 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  32.39 
 
 		 840 aa  355  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  32.97 
 
 		 873 aa  355  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  29.99 
 
 		 877 aa  352  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  28.97 
 
 		 847 aa  350  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  28.84 
 
 		 826 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  31.21 
 
 		 826 aa  340  5e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  39.85 
 
 		 839 aa  328  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  37.05 
 
 		 852 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  28.97 
 
 		 783 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  29.33 
 
 		 833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  29.73 
 
 		 851 aa  314  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.19 
 
 		 841 aa  314  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  32.19 
 
 		 723 aa  310  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  29.7 
 
 		 878 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.77 
 
 		 832 aa  303  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  31.02 
 
 		 790 aa  297  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  31.81 
 
 		 790 aa  297  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  34.46 
 
 		 716 aa  296  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  32.42 
 
 		 876 aa  294  4e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  31.91 
 
 		 790 aa  293  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  29.6 
 
 		 843 aa  289  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  31.41 
 
 		 805 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  31.53 
 
 		 792 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  35.73 
 
 		 722 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  32.63 
 
 		 834 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  30.76 
 
 		 822 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  31.4 
 
 		 792 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  31.2 
 
 		 790 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  29.89 
 
 		 818 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  29.03 
 
 		 736 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  34.35 
 
 		 637 aa  268  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  35.17 
 
 		 638 aa  268  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  35.67 
 
 		 638 aa  267  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  33.57 
 
 		 639 aa  267  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  35.23 
 
 		 638 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  35.42 
 
 		 638 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  35.23 
 
 		 638 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  35.1 
 
 		 655 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  34.67 
 
 		 649 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  35.02 
 
 		 638 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  34.6 
 
 		 638 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  34.09 
 
 		 638 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  35.02 
 
 		 638 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  33.16 
 
 		 667 aa  260  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  35.2 
 
 		 638 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  34.53 
 
 		 640 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  33.27 
 
 		 629 aa  258  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  33.65 
 
 		 644 aa  257  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  32.87 
 
 		 621 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  34.59 
 
 		 653 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  34.59 
 
 		 653 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  34.14 
 
 		 669 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  34.59 
 
 		 667 aa  253  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  34.4 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  34.4 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  34.4 
 
 		 667 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  34.4 
 
 		 667 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  34.4 
 
 		 667 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  49.61 
 
 		 746 aa  251  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  32.98 
 
 		 622 aa  251  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  33.08 
 
 		 654 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  33.64 
 
 		 667 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  34.27 
 
 		 652 aa  249  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  33.33 
 
 		 641 aa  248  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  34.34 
 
 		 654 aa  247  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  28.4 
 
 		 746 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  34.34 
 
 		 654 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  34.34 
 
 		 654 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  34.34 
 
 		 654 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  34.34 
 
 		 654 aa  245  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  34.71 
 
 		 668 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  34.65 
 
 		 667 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  34.03 
 
 		 668 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.59 
 
 		 411 aa  241  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  28.14 
 
 		 805 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  33.84 
 
 		 668 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  32.53 
 
 		 672 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  34.33 
 
 		 692 aa  240  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>