93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0165 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
195 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.54794e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  66.67 
 
 
210 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.73949e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  56.76 
 
 
200 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  53.19 
 
 
194 aa  211  6e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.80152e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  47.34 
 
 
201 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  47.34 
 
 
201 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  48.44 
 
 
199 aa  200  1e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  46.77 
 
 
191 aa  200  1e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  51.87 
 
 
201 aa  199  2e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  52.57 
 
 
197 aa  191  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1140  nucleoside recognition domain-containing protein  48.45 
 
 
196 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1563  spore maturation protein A  46.63 
 
 
198 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58418e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1491  spore maturation protein A  46.63 
 
 
198 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1380  spore maturation protein A  46.63 
 
 
198 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1595  spore maturation protein A  46.07 
 
 
198 aa  185  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3820  spore maturation protein A  46.63 
 
 
198 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09471e-12 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  44.1 
 
 
201 aa  184  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1525  spore maturation protein A  46.63 
 
 
198 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2093  nucleoside recognition domain protein  45.13 
 
 
197 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.752019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1353  spore maturation protein A  46.07 
 
 
198 aa  184  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1631  spore maturation protein A  46.07 
 
 
198 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1352  spore maturation protein A  46.07 
 
 
198 aa  184  1e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.250513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  55.17 
 
 
202 aa  182  2e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1393  nucleoside recognition domain-containing protein  46.07 
 
 
198 aa  182  2e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  55.17 
 
 
201 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  42.56 
 
 
197 aa  181  5e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  50.27 
 
 
193 aa  181  8e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  43.85 
 
 
437 aa  180  9e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  43.01 
 
 
194 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  45.55 
 
 
427 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  42.27 
 
 
194 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  42.49 
 
 
198 aa  179  3e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.71237e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1194  nucleoside recognition domain-containing protein  46.07 
 
 
198 aa  179  3e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  56.36 
 
 
202 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  43.52 
 
 
198 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3908  spore maturation protein  44.74 
 
 
196 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  54.32 
 
 
419 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  45.74 
 
 
408 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  43.65 
 
 
432 aa  174  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  44.79 
 
 
419 aa  174  1e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  44.93 
 
 
414 aa  172  2e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  43.62 
 
 
408 aa  172  2e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  47.37 
 
 
459 aa  172  2e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  42.27 
 
 
408 aa  171  6e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  44.15 
 
 
408 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  41.03 
 
 
412 aa  170  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3903  nucleoside recognition domain protein  44.2 
 
 
191 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  43.46 
 
 
410 aa  167  7e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  41.92 
 
 
408 aa  167  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  42.78 
 
 
408 aa  164  6e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  42.78 
 
 
408 aa  164  6e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  42.78 
 
 
408 aa  164  1e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3988  nucleoside recognition domain protein  43.09 
 
 
191 aa  164  1e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91988e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  42.27 
 
 
408 aa  163  2e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  43.09 
 
 
408 aa  162  2e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  43.09 
 
 
408 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  40.21 
 
 
408 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2857  spore maturation protein A  45.5 
 
 
192 aa  161  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  42.55 
 
 
408 aa  161  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  42.27 
 
 
414 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  5.2654e-11  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  43.09 
 
 
408 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  43.72 
 
 
412 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2542  spore maturation protein A  45.21 
 
 
192 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  40.59 
 
 
411 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  46.71 
 
 
414 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.70625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  39.13 
 
 
417 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  39.13 
 
 
417 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  48.32 
 
 
412 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  40.21 
 
 
440 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  41.58 
 
 
411 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  39.56 
 
 
409 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  43.46 
 
 
409 aa  152  3e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  41.5 
 
 
417 aa  150  9e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  42.77 
 
 
415 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  42.77 
 
 
415 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  45.28 
 
 
423 aa  146  2e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  42.77 
 
 
415 aa  145  4e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  38.66 
 
 
409 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  37.37 
 
 
409 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  41.05 
 
 
409 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  37.37 
 
 
409 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  36.84 
 
 
409 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  36.84 
 
 
409 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  38.97 
 
 
409 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  38.97 
 
 
409 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  37.37 
 
 
413 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  37.89 
 
 
409 aa  140  1e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  36.84 
 
 
413 aa  139  2e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1253  nucleoside recognition domain protein  50 
 
 
333 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  39.49 
 
 
409 aa  133  2e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2584  nucleoside recognition domain protein  34.38 
 
 
189 aa  127  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0491537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  37.16 
 
 
476 aa  120  1e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  38.19 
 
 
479 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>