More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0132 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  42.4 
 
 
879 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  42.25 
 
 
877 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  100 
 
 
893 aa  1829    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  42.37 
 
 
877 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  39.34 
 
 
910 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  43.41 
 
 
885 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.47 
 
 
908 aa  666    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.91 
 
 
918 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  54.13 
 
 
876 aa  940    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  41.97 
 
 
881 aa  694    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  60.55 
 
 
882 aa  1062    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  41.14 
 
 
894 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.19 
 
 
894 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  46.59 
 
 
874 aa  773    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  46.82 
 
 
874 aa  776    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  42.3 
 
 
902 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  53.23 
 
 
887 aa  929    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  40.07 
 
 
914 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  41.43 
 
 
901 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  41.28 
 
 
900 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
906 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.22 
 
 
895 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  36.99 
 
 
939 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  39.32 
 
 
879 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  39.3 
 
 
871 aa  581  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  38.96 
 
 
875 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  39.12 
 
 
855 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  37.62 
 
 
857 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  38.66 
 
 
856 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  40.16 
 
 
861 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  39.93 
 
 
861 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  38.06 
 
 
856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  38.83 
 
 
861 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  38.42 
 
 
890 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  37.34 
 
 
896 aa  560  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  38.42 
 
 
856 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  38.02 
 
 
865 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  38.15 
 
 
858 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  37.28 
 
 
856 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  38.17 
 
 
862 aa  525  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  37.27 
 
 
855 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  37.27 
 
 
855 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  36.44 
 
 
855 aa  515  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  35.08 
 
 
878 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  33.56 
 
 
886 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 
872 aa  492  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  33.56 
 
 
886 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  34 
 
 
883 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  33.78 
 
 
741 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  35.21 
 
 
723 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  36.52 
 
 
755 aa  436  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  35.76 
 
 
746 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  34.8 
 
 
723 aa  429  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  34.92 
 
 
743 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  34.61 
 
 
727 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  33.61 
 
 
727 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  34.11 
 
 
730 aa  419  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  34.63 
 
 
751 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  34.02 
 
 
730 aa  405  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  34.34 
 
 
748 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  35.71 
 
 
722 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  33.92 
 
 
744 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  35.93 
 
 
560 aa  243  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  27.59 
 
 
741 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.33 
 
 
622 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  32.57 
 
 
538 aa  209  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.68 
 
 
636 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  30.89 
 
 
664 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  29.91 
 
 
637 aa  191  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  35.76 
 
 
328 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  31.58 
 
 
646 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  32.23 
 
 
584 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  38.37 
 
 
576 aa  177  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.02 
 
 
647 aa  177  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.51 
 
 
573 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.53 
 
 
778 aa  171  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.74 
 
 
778 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
1103 aa  168  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.62 
 
 
755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.13 
 
 
755 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.93 
 
 
757 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  29.64 
 
 
427 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  38.68 
 
 
594 aa  164  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.23 
 
 
578 aa  163  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  31.87 
 
 
597 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.13 
 
 
725 aa  156  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.02 
 
 
754 aa  153  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
593 aa  153  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.27 
 
 
584 aa  150  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  30.34 
 
 
612 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  28.54 
 
 
1086 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  31.6 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  31.6 
 
 
581 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  31.29 
 
 
581 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  31.6 
 
 
585 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  30.46 
 
 
579 aa  148  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
588 aa  148  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  28.26 
 
 
441 aa  147  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  32.19 
 
 
571 aa  147  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>