61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0131 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  58.71 
 
 
269 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  58.11 
 
 
269 aa  335  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  55.38 
 
 
273 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  52.09 
 
 
273 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  47.1 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  47.31 
 
 
269 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  46.15 
 
 
284 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  46.33 
 
 
280 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  43.19 
 
 
288 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  45.86 
 
 
278 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  45.11 
 
 
275 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  41.2 
 
 
293 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  41.22 
 
 
281 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  36.15 
 
 
284 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  37.69 
 
 
274 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  37.84 
 
 
327 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  34.5 
 
 
287 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  36.6 
 
 
328 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  34.88 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  34.63 
 
 
287 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  34.63 
 
 
287 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  33.33 
 
 
297 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  34.46 
 
 
294 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  33.7 
 
 
279 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  35.25 
 
 
291 aa  161  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  33.09 
 
 
291 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  33.21 
 
 
289 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  31.43 
 
 
289 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  30.89 
 
 
611 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  32.86 
 
 
295 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  30.36 
 
 
317 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  29.66 
 
 
458 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  28.07 
 
 
474 aa  92.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  29.88 
 
 
323 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  27.91 
 
 
339 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  28.28 
 
 
587 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  25.35 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  27.62 
 
 
348 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  27.85 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  25.58 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  28.05 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  27.52 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  30.81 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  31.3 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  31.3 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  23.96 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  27.31 
 
 
559 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  23.45 
 
 
331 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  26.11 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  27.44 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  21.52 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3268  cyanophycinase-like protein  28.95 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.890321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  25.93 
 
 
598 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  25.84 
 
 
541 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  21.96 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  21.96 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  28.79 
 
 
541 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  23.5 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  26.38 
 
 
374 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  21.5 
 
 
232 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>