More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0125 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 302 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  25.87 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  28.21 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.83 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  36.59 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 537 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 1201 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 519 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 277 aa  89  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 538 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 508 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  24.63 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 257 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  24.72 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  27.32 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  26.46 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.13 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 760 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  23.89 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  21.57 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 686 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 686 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  24.17 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 548 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 571 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  23.92 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 168 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  22.39 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>