More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0071 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 593 aa  1224    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  35.97 
 
 		 618 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1793  hypothetical protein  26.07 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0647755  hitchhiker  0.00106985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 848 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  84.62 
 
 		 897 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  81.48 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 894 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  80.77 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  84 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 1200 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  69.7 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  42.25 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 866 aa  56.6  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 864 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  30.33 
 
 		 658 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  38.46 
 
 		 888 aa  57  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  67.65 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  70 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  70 
 
 		 161 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  33.33 
 
 		 834 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  87.5 
 
 		 167 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  76.92 
 
 		 249 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  84 
 
 		 253 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  76.92 
 
 		 228 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  58.54 
 
 		 844 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 162 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 921 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  74.07 
 
 		 239 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  80.77 
 
 		 420 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 160 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 170 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  52.38 
 
 		 235 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  76.92 
 
 		 276 aa  55.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 276 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 858 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 958 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  80.77 
 
 		 160 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  86.36 
 
 		 228 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 910 aa  54.3  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 836 aa  54.3  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  76.92 
 
 		 160 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  68.97 
 
 		 909 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  87.5 
 
 		 899 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  84 
 
 		 272 aa  54.3  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 800 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  67.65 
 
 		 221 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  67.65 
 
 		 221 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 859 aa  54.3  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  67.65 
 
 		 221 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 837 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  60.61 
 
 		 1136 aa  53.9  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  67.65 
 
 		 221 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  67.65 
 
 		 221 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 164 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  76.92 
 
 		 166 aa  53.5  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  62.5 
 
 		 61 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 838 aa  53.9  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 164 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 1029 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  48.94 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  95.24 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 156 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  80 
 
 		 283 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 912 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 1031 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  38.55 
 
 		 259 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 872 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 837 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  58.33 
 
 		 881 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  63.64 
 
 		 962 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 962 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  79.17 
 
 		 278 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 962 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  80 
 
 		 166 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 932 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 922 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 897 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 896 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 1017 aa  52.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 162 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  43.4 
 
 		 916 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  86.36 
 
 		 237 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  86.36 
 
 		 267 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  50 
 
 		 830 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 944 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  90.48 
 
 		 151 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 421 aa  52.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 135 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 835 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  33.03 
 
 		 925 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 378 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  60 
 
 		 225 aa  51.6  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 833 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 845 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 897 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>