31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0062 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  100 
 
 		 331 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  27.6 
 
 		 355 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  39.56 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  24.01 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.6 
 
 		 781 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  31.65 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  33.64 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  24.73 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 		 421 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  21.4 
 
 		 872 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.76 
 
 		 726 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.76 
 
 		 726 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  24.28 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  25.35 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.05 
 
 		 752 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.34 
 
 		 749 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.47 
 
 		 795 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.59 
 
 		 797 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  32.47 
 
 		 795 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.96 
 
 		 682 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>