More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0058 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  45.9 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.11 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 90 aa  57  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  36.99 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  36.99 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  27.06 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 256 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  38.03 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  25.77 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  25.77 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  34.52 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>