More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0055 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  100 
 
 		 94 aa  189  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  65.96 
 
 		 95 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  50 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  51.06 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  47.87 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  47.87 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  46.74 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  35.56 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  32.26 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  27.66 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  27.66 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  27.66 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1087  30S ribosomal protein S6  26.6 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000589418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0927  30S ribosomal protein S6  26.6 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>