98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0040 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  100 
 
 
338 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  35.05 
 
 
362 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  31.56 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  35.09 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  22.53 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.41 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  23.71 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  33.33 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  27.98 
 
 
297 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  24.85 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  36.04 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  36.84 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  26.25 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  32.29 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  32.48 
 
 
775 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  28.33 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  35.23 
 
 
221 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  34.88 
 
 
246 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  29.81 
 
 
299 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  34.04 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  37.66 
 
 
280 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  30.21 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25.82 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  25.82 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  34.29 
 
 
830 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  32.22 
 
 
241 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  27.37 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  31.67 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  32.67 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.32 
 
 
228 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.91 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  23.78 
 
 
346 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  30.19 
 
 
432 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  28.57 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  25.84 
 
 
228 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  25.84 
 
 
228 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  25.84 
 
 
228 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  25 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  34.29 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  28.33 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  26.96 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  24.73 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  27.5 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  24.73 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  24.73 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  24.73 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  27.5 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  35.48 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1586  Abortive infection protein  35.62 
 
 
359 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.099393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  30.53 
 
 
241 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  37.23 
 
 
240 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25.36 
 
 
228 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1491  Abortive infection protein  35.62 
 
 
359 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0494011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
284 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  26.11 
 
 
269 aa  49.3  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2373  abortive infection protein  36.99 
 
 
359 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  26.94 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
282 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  28.68 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  35.42 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  34.23 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  32.35 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  32.26 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  34.38 
 
 
216 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
216 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  28.83 
 
 
336 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  32.26 
 
 
244 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  33.65 
 
 
274 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  24.59 
 
 
527 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  24.59 
 
 
527 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  32.69 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  26.87 
 
 
521 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1494  abortive infection protein  31.03 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.81139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  29.25 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  29.31 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.29 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.18 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  26.35 
 
 
180 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  28.87 
 
 
261 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  33.64 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  28.74 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  29.63 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  32.99 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  29.35 
 
 
176 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  33.33 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  31.58 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  26.09 
 
 
246 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  29.7 
 
 
244 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.13 
 
 
249 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  29.21 
 
 
255 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>