24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0036 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0036  germination protein YpeB  100 
 
 
463 aa  952    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2416  peptidase  50.55 
 
 
464 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1792  germination protein YpeB  37.17 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0040  germination protein YpeB  34.95 
 
 
454 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3194  peptidase  34.58 
 
 
452 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0608  peptidase  37.08 
 
 
444 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.923748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03070  Spore germination YpeB  31.99 
 
 
443 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0201  peptidase  34.16 
 
 
459 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2185  putative spore germination protein  28.7 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2780  hypothetical protein  29.02 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0914659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2174  germination protein YpeB  28.89 
 
 
447 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2801  germination protein YpeB  28.57 
 
 
446 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2517  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2482  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2533  germination protein YpeB  28.57 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000080241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2561  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2747  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2755  germination protein YpeB  28.34 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2759  germination protein YpeB  28.57 
 
 
446 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2552  spore germination YpeB  28.34 
 
 
446 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1896  spore germination YpeB  28.12 
 
 
446 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00637091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0450  germination protein YpeB  26.82 
 
 
447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4848  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.51 
 
 
454 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.276733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1708  hypothetical protein  27.22 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.283078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>