More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0033 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  45.59 
 
 		 337 aa  234  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  29.03 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  32 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  32 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  32 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  32 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  32 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  32 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  31.11 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  30.67 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  30.67 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  32 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  29.48 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  26.51 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  27.34 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  25.52 
 
 		 424 aa  92.8  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  26 
 
 		 580 aa  90.1  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  36.84 
 
 		 154 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  36.84 
 
 		 154 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  36.84 
 
 		 154 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  36.84 
 
 		 154 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  36.84 
 
 		 154 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 150 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  25.52 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 188 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  36.97 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  32.88 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  36.97 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  36.97 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40.35 
 
 		 155 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  36.13 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  36.13 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  35.29 
 
 		 154 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  26.22 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 154 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  37.93 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  36.67 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  37.93 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  34.59 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  33.11 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  39.64 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  29.63 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.98 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 196 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  32.77 
 
 		 191 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.14 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.14 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.98 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.14 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.14 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.14 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.14 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.14 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  37.29 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  31.93 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  25.23 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 150 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  36.03 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  33.58 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  40.54 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.18 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  33.11 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>