125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0032 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1348    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  43.15 
 
 		 883 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  27.17 
 
 		 711 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  34.24 
 
 		 922 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  34.8 
 
 		 922 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.47 
 
 		 723 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  25.04 
 
 		 617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.69 
 
 		 724 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  47.31 
 
 		 821 aa  90.5  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  44.86 
 
 		 830 aa  85.5  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  36.73 
 
 		 974 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  46.51 
 
 		 787 aa  83.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  35.37 
 
 		 974 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1186 aa  82.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  34.97 
 
 		 974 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  45.26 
 
 		 1065 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  34.01 
 
 		 877 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  39.78 
 
 		 758 aa  80.9  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  39.78 
 
 		 758 aa  80.5  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  34.01 
 
 		 974 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 974 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1280 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  33.1 
 
 		 973 aa  77  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  34.25 
 
 		 974 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  33.58 
 
 		 1163 aa  74.7  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  37.19 
 
 		 1153 aa  73.9  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1167 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  29.51 
 
 		 1167 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  32 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1181 aa  73.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  26.37 
 
 		 979 aa  71.6  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1157 aa  70.9  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  31.13 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  34.95 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1149 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1185 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  26.51 
 
 		 917 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1282 aa  64.7  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  32.56 
 
 		 993 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  32.56 
 
 		 993 aa  64.3  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1210 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 		 993 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  31.3 
 
 		 1019 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1156 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1156 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1156 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1156 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1284 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  36.63 
 
 		 818 aa  62.4  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1156 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1156 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1153 aa  60.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1156 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  28.83 
 
 		 994 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  30.56 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  34.41 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  34.41 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1160 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  31.53 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1354 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1126 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  40 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  40 
 
 		 974 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  40 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1155 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  29.55 
 
 		 1047 aa  55.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  25 
 
 		 1144 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  30.37 
 
 		 968 aa  54.3  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  29.46 
 
 		 812 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1277 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1348 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1127 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  19.3 
 
 		 757 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  33.73 
 
 		 890 aa  52.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  42.5 
 
 		 1181 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  44 
 
 		 1047 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  44.23 
 
 		 1201 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 		 852 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 		 852 aa  50.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  28.93 
 
 		 978 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  27.44 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  37.5 
 
 		 768 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1157 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  40 
 
 		 1351 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1158 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  26.41 
 
 		 1165 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1467 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  22.36 
 
 		 575 aa  48.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  22.99 
 
 		 798 aa  47.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1152 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1152 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  40.32 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1414 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  28.79 
 
 		 870 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>