More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0001 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
440 aa  907  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  73.36 
 
 
443 aa  666  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  63.3 
 
 
457 aa  594  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  63.08 
 
 
457 aa  594  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.51 
 
 
453 aa  561  1e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  61.64 
 
 
446 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  60.91 
 
 
446 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  60.91 
 
 
446 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  60.91 
 
 
446 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  60.91 
 
 
446 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  60.96 
 
 
446 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  60.91 
 
 
446 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  58.45 
 
 
443 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  58.33 
 
 
450 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  60.73 
 
 
446 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  60.27 
 
 
446 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  60.73 
 
 
446 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 
446 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  59.86 
 
 
441 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  58.11 
 
 
450 aa  541  1e-152  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  57.86 
 
 
442 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.24 
 
 
463 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.24 
 
 
446 aa  506  1e-142  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.96 
 
 
449 aa  506  1e-142  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.93 
 
 
454 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.94 
 
 
454 aa  492  1e-138  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.12 
 
 
444 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  54.57 
 
 
445 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  53.38 
 
 
451 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  53.49 
 
 
436 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  53.56 
 
 
453 aa  469  1e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  53.56 
 
 
453 aa  469  1e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.51 
 
 
443 aa  469  1e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.1 
 
 
453 aa  466  1e-130  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.89 
 
 
439 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  47.2 
 
 
472 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.77 
 
 
478 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.77 
 
 
456 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  48.21 
 
 
449 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  48.54 
 
 
445 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50 
 
 
439 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  46.61 
 
 
458 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  46.09 
 
 
460 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  47.56 
 
 
450 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.45 
 
 
461 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  48.67 
 
 
459 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  45.78 
 
 
481 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.75 
 
 
447 aa  421  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  55 
 
 
495 aa  415  1e-115  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  55 
 
 
495 aa  415  1e-115  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  55 
 
 
495 aa  415  1e-115  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
452 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.89 
 
 
587 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  44.82 
 
 
480 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.89 
 
 
591 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.43 
 
 
450 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.12 
 
 
480 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  55.85 
 
 
494 aa  405  1e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  55.75 
 
 
492 aa  408  1e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.15 
 
 
509 aa  405  1e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  45.2 
 
 
460 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  45.93 
 
 
470 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  48.21 
 
 
450 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  46.77 
 
 
453 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  45.03 
 
 
460 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.64 
 
 
721 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  43.64 
 
 
482 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  46.77 
 
 
453 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.62 
 
 
566 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.49 
 
 
473 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.84064e-14 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.71 
 
 
474 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  3.98294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 
456 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.91 
 
 
528 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.85 
 
 
489 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  46.77 
 
 
453 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  45.23 
 
 
452 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  48 
 
 
464 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.3935e-05  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  45.23 
 
 
452 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  45.09 
 
 
461 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  44.71 
 
 
472 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  44.14 
 
 
454 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  54.21 
 
 
597 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.78732e-07  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 
462 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 
462 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  44.39 
 
 
459 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.81636e-06  unclonable  3.44978e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 
462 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 
462 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.84 
 
 
465 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.79 
 
 
464 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  44.74 
 
 
465 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.41 
 
 
490 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  44.52 
 
 
460 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  58.81 
 
 
582 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.16 
 
 
503 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.09 
 
 
468 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.44 
 
 
458 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 
461 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  55.72 
 
 
557 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.31 
 
 
652 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  43.72 
 
 
451 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>