279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0055 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.22 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  93.22 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  93.22 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  93.22 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  88 
 
 
153 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  91.53 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  91.53 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  88 
 
 
153 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  88 
 
 
153 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  94 
 
 
155 bp  75.8  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88.41 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  91.23 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  88.41 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  91.07 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  88.24 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  86.67 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.67 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>