More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5450 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  356  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  73.74 
 
 		 183 aa  265  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  70.95 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  73.38 
 
 		 159 aa  223  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  48.88 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 180 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  48.31 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  47.28 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.93 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  42.22 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  43.5 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  45.79 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  42.08 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  39.33 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 191 aa  130  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  45.56 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  42.31 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  42.94 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  37.7 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  48.95 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  42.7 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  37.7 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.89 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  45.14 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.53 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.11 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  48.07 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.98 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  40.98 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  40.98 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.69 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.62 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.08 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.26 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  45.52 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  40.45 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  40 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  47.75 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  45 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  39.67 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  37.08 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.33 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.8 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  42.7 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  45.45 
 
 		 309 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  40.96 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 194 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  43.79 
 
 		 293 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  45.27 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.37 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  43.89 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  42.29 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.75 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  38.46 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  43.17 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.86 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.86 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.86 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.12 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  47.55 
 
 		 293 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  47.55 
 
 		 326 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 307 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 307 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  38.25 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  42.31 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  40.43 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.52 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.52 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  47.55 
 
 		 293 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  50.72 
 
 		 310 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.23 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.23 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>