More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5431 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
407 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.17 
 
 
405 aa  726    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.87 
 
 
400 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.78 
 
 
399 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  52.64 
 
 
400 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  55.23 
 
 
391 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  51.9 
 
 
400 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  49.37 
 
 
399 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  52.96 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  53.21 
 
 
390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.96 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  52.96 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  53.21 
 
 
390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  52.96 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.9 
 
 
395 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  49.61 
 
 
393 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  44.61 
 
 
396 aa  332  8e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  38.89 
 
 
396 aa  299  6e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
428 aa  298  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  39.49 
 
 
401 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  42.2 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  41.46 
 
 
424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.54 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  35.98 
 
 
416 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.23 
 
 
395 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.01 
 
 
400 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  38.06 
 
 
401 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.26 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.75 
 
 
400 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.04 
 
 
395 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.01 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  38.69 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.94 
 
 
400 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.84 
 
 
396 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.96 
 
 
398 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0226  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.51 
 
 
401 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 
391 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.71 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0804  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.77 
 
 
402 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145956  normal  0.0180987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.48 
 
 
389 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4366  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.37 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000326291  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.27 
 
 
391 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  33.88 
 
 
395 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.39 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.46 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  36.34 
 
 
424 aa  235  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.43 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.43 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.71 
 
 
396 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.84 
 
 
397 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 
451 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0961  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.48 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.87 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0118  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.43 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.6 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.53 
 
 
392 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.6 
 
 
403 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.9 
 
 
401 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.9 
 
 
401 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.87 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.87 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.87 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.87 
 
 
398 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.53 
 
 
394 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.17 
 
 
393 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1510  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.84 
 
 
399 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0574329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.49 
 
 
399 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.49 
 
 
399 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.9 
 
 
389 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.84 
 
 
399 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410368  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0006  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.84 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.84 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.94 
 
 
381 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1151  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.84 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326917  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1431  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.84 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.09 
 
 
399 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.59 
 
 
398 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.01 
 
 
397 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  36.59 
 
 
398 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.59 
 
 
398 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.59 
 
 
398 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.23 
 
 
397 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  37.6 
 
 
771 aa  229  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.81 
 
 
390 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02519  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.46 
 
 
402 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.253704  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
399 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.89 
 
 
391 aa  229  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36 
 
 
399 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.33 
 
 
395 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
399 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.36 
 
 
388 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.94 
 
 
393 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
381 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.87 
 
 
395 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.87 
 
 
395 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.31 
 
 
398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.31 
 
 
398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.97 
 
 
399 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.31 
 
 
398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>