More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5309 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
380 aa  755    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.47 
 
 
377 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.78 
 
 
380 aa  228  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.23 
 
 
331 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.14 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.1 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.36 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.36 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.62 
 
 
360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  36.03 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.82 
 
 
383 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.93 
 
 
376 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.16 
 
 
378 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.21 
 
 
363 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  32.3 
 
 
363 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  33.51 
 
 
364 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  33.42 
 
 
365 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.15 
 
 
373 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.04 
 
 
378 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  33.42 
 
 
364 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  33.25 
 
 
364 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  33.42 
 
 
364 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.62 
 
 
373 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  32.12 
 
 
363 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  33.16 
 
 
364 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.19 
 
 
373 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.67 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.68 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.31 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.67 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.07 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.1 
 
 
373 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  32.47 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  31.71 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.67 
 
 
355 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.67 
 
 
355 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  32.64 
 
 
376 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  35.55 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.99 
 
 
367 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.54 
 
 
323 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  33.6 
 
 
350 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.62 
 
 
316 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.93 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.82 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  33.16 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  36.15 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.73 
 
 
377 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.4 
 
 
313 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.56 
 
 
315 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.03 
 
 
354 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.85 
 
 
377 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.92 
 
 
363 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.18 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.6 
 
 
376 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.6 
 
 
376 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.79 
 
 
321 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.6 
 
 
376 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.82 
 
 
362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.56 
 
 
315 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.45 
 
 
371 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.84 
 
 
368 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.06 
 
 
376 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  33.61 
 
 
321 aa  159  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  34.68 
 
 
321 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.05 
 
 
316 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  31.5 
 
 
409 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  32.45 
 
 
378 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.48 
 
 
375 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.29 
 
 
354 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.26 
 
 
366 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.05 
 
 
360 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.37 
 
 
372 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.73 
 
 
381 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  32.73 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.99 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.74 
 
 
320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.95 
 
 
316 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.18 
 
 
319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.63 
 
 
361 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 
364 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.12 
 
 
353 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 
378 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.21 
 
 
357 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.16 
 
 
361 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.8 
 
 
359 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.73 
 
 
309 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.26 
 
 
344 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.11 
 
 
324 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.89 
 
 
353 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.08 
 
 
329 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.7 
 
 
366 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.42 
 
 
350 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.21 
 
 
386 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  29.21 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.66 
 
 
325 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.28 
 
 
325 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.81 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  31.87 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.49 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.78 
 
 
319 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>