291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5308 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  68.49 
 
 
148 aa  216  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  45.45 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  45.45 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  45.45 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  44.29 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  43.36 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 
144 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  44.93 
 
 
150 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
183 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.69 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
181 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
135 aa  57  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.82 
 
 
126 aa  57  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.82 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.67 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.57 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.47 
 
 
209 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.09 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  29.66 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  29.66 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  26.09 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.3 
 
 
158 aa  52  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
169 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
146 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.91 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  28.47 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.81 
 
 
165 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  28.45 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  23.39 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  22.79 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  22.79 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  22.06 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  22.06 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  22.06 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  24.44 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  22.06 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  26.8 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  26.15 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.6 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.6 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  30.33 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.35 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  27.35 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  27.35 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  26.89 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  26.53 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  28.17 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  23.91 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  27.5 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
136 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  26.67 
 
 
129 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
138 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>