31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5295 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5295  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.7 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.64 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.74 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  47.92 
 
 
561 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.75 
 
 
390 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  46.27 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.03 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.5 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.48 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.59 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.29 
 
 
197 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.86 
 
 
467 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36 
 
 
522 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  40.32 
 
 
432 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.62 
 
 
482 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.62 
 
 
482 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.62 
 
 
482 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.62 
 
 
482 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  38 
 
 
198 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.43 
 
 
205 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  43.75 
 
 
224 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  26.26 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40 
 
 
472 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>