183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5199 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  67.42 
 
 
184 aa  261  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  60.12 
 
 
175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  57.54 
 
 
179 aa  231  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  57.23 
 
 
179 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  57.74 
 
 
190 aa  214  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  57.89 
 
 
182 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  57.89 
 
 
182 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  54.97 
 
 
181 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  58.48 
 
 
189 aa  209  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  57.65 
 
 
176 aa  207  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  54.29 
 
 
188 aa  207  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  56.47 
 
 
175 aa  207  9e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  56.07 
 
 
189 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  56.29 
 
 
190 aa  197  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.98 
 
 
175 aa  197  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  53.22 
 
 
190 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  50 
 
 
174 aa  189  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  46.2 
 
 
245 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  49.4 
 
 
248 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  45.56 
 
 
247 aa  160  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  45.56 
 
 
247 aa  160  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  45.56 
 
 
251 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  46.75 
 
 
247 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  47.83 
 
 
233 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  46.15 
 
 
243 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  46.15 
 
 
243 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  44.57 
 
 
242 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  44 
 
 
242 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  43.43 
 
 
259 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  44.57 
 
 
247 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  48.98 
 
 
249 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  42.86 
 
 
242 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  47.62 
 
 
248 aa  154  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  47.62 
 
 
248 aa  154  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  44.38 
 
 
243 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  44.44 
 
 
247 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  43.43 
 
 
243 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  44.38 
 
 
243 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  44.77 
 
 
245 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  43.43 
 
 
243 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  43.86 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  44 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  43.43 
 
 
243 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  43.43 
 
 
243 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  43.43 
 
 
243 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  43.35 
 
 
238 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  42.11 
 
 
242 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  44.44 
 
 
249 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  44.52 
 
 
161 aa  131  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.34 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  45.1 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  42.36 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  40.34 
 
 
166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.98 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.37 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  44.44 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  42.48 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  43.75 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  43.57 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  43.51 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  50 
 
 
214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  50 
 
 
214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  50 
 
 
214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  50 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  40.91 
 
 
168 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  50 
 
 
185 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  42.67 
 
 
160 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  42.21 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  37.93 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  40.91 
 
 
168 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  47.46 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  36.42 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  35.63 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  41.55 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  37.36 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  42.61 
 
 
162 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.61 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  39.44 
 
 
161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  39.61 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  39.61 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  37.93 
 
 
160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  39.61 
 
 
168 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  40 
 
 
157 aa  111  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  40.26 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  41.43 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.41 
 
 
167 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  38.82 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  35.84 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  47.37 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.06 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  44.74 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  45.61 
 
 
168 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  38.3 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  41.98 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  33.14 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
158 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>