More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5088 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
385 aa  765    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  65.89 
 
 
377 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  67.27 
 
 
378 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  65.35 
 
 
379 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 
378 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  60.52 
 
 
378 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.53 
 
 
380 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 
382 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  58.33 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  62.6 
 
 
378 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  56.25 
 
 
373 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.35 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 
398 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  49.02 
 
 
398 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.11 
 
 
390 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  345  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
390 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
390 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.72 
 
 
391 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
390 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  46.6 
 
 
390 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
388 aa  338  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  47.78 
 
 
390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.95 
 
 
387 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  47.77 
 
 
399 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  45.79 
 
 
406 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.44 
 
 
392 aa  332  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.85 
 
 
394 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.47 
 
 
387 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.19 
 
 
387 aa  332  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.45 
 
 
387 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.69 
 
 
387 aa  329  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 
392 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 
390 aa  328  7e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  46.74 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.46 
 
 
387 aa  326  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  46.38 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.89 
 
 
401 aa  325  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.89 
 
 
401 aa  325  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.89 
 
 
401 aa  325  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.21 
 
 
387 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.48 
 
 
424 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.51 
 
 
401 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.16 
 
 
401 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.96 
 
 
387 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  45.54 
 
 
406 aa  322  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.72 
 
 
387 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.46 
 
 
387 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.71 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.46 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.46 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.46 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.46 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.21 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.43 
 
 
387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.77 
 
 
401 aa  319  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
384 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
390 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.01 
 
 
391 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.04 
 
 
399 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.27 
 
 
391 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  44.8 
 
 
406 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.27 
 
 
391 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  47.5 
 
 
403 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.69 
 
 
406 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  45.16 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.79 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.78 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.69 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.38 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.54 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.54 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.54 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.41 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  42.57 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.91 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
405 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.73 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>