More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5046 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  53.99 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  52.15 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  54.04 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  54.27 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  53.5 
 
 		 337 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  53.66 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  52.48 
 
 		 342 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  53.5 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  53.99 
 
 		 407 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  53.5 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  52.15 
 
 		 330 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  51.37 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  53.37 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  52.15 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  52.28 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  53.54 
 
 		 333 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  52.58 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  50 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  50 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  51.79 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  53.19 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  52.74 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  51.66 
 
 		 331 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  52.28 
 
 		 332 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  47.8 
 
 		 348 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  49.54 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  51.66 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  49.11 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  48.82 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.83 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  49.85 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  52.62 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  45.6 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  45.91 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.91 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  50.77 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  44.44 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.55 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  45.6 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  45.28 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  51.91 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  46.79 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  45.95 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  45.18 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  46.48 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  46.93 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  45.57 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.72 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  37.85 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  37.85 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  39.56 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.05 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  34.98 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  34.98 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.61 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.7 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  34.7 
 
 		 360 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 341 aa  158  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.39 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.77 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.68 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.68 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.27 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.22 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.3 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  29.01 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  28.15 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.69 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  31.23 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.38 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.3 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.69 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  27.95 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.2 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.96 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.82 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.8 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  31.35 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  28.37 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  30.9 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.45 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.11 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  27.91 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.03 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 644 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.59 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  30.26 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.34 
 
 		 645 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.39 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>