More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5034 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  65.07 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  63.33 
 
 		 219 aa  254  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  60.28 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  63.81 
 
 		 219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  62.86 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  61.9 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  61.43 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  58.49 
 
 		 218 aa  246  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  62.38 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  58.22 
 
 		 218 aa  245  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  62.74 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  62.38 
 
 		 221 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  62.26 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  61.32 
 
 		 221 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  58.96 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  58.88 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  59.91 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  59.43 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  58.22 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  58.6 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  57.75 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  60.38 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  58.64 
 
 		 226 aa  231  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  61.62 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  58.64 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  58.49 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  59.72 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  59.71 
 
 		 227 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  62.37 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  57.14 
 
 		 226 aa  225  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  58.79 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  57.77 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  57.21 
 
 		 230 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  54.93 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  54.03 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  45.83 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  58.25 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  51.43 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  58.41 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  52.34 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  54.97 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  47 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.5 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.04 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.38 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  45.91 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.62 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  45.61 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.57 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  38.67 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.27 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  38.81 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  38.03 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  42.4 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  42.2 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.5 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  40.52 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  39.37 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.37 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  39.37 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  39.37 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.37 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  40.95 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.27 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  37.67 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  37.17 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  45.95 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.67 
 
 		 244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  45.95 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  45.95 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  45.95 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.36 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.37 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.25 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  45.95 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.61 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  40.99 
 
 		 239 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.44 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  41.36 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.67 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  45.5 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  45.5 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.46 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>