More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5009 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  52.24 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  48.71 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  50.55 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  50.55 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  49.27 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  50 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  50.93 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.91 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  47.27 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  45.56 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  46.93 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  45.52 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  47.21 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  48.88 
 
 		 284 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.93 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  49.43 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  46.43 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  47.92 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  48.31 
 
 		 262 aa  242  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  46.21 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  46.1 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  46.64 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  46.64 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  46.79 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 		 270 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.49 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  45.52 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  46.04 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  46.13 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  45.66 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  45.66 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  44.03 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  46.5 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  43.87 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  37.73 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  35.9 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  35.77 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  35.64 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  37.64 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.27 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  37.64 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  36.53 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  34.59 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  34.96 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  34.67 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  35.74 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  34.55 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  36.53 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  35.94 
 
 		 291 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  35.66 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  32.97 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  36.7 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  35.27 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  34.31 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  33.94 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  35.69 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  34.67 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  38.06 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  36.06 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.53 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.17 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  37.23 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  35.79 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.69 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  35.69 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  35.79 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  35.42 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.81 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  35.13 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  36.79 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>