68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4852 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 
999 aa  1935    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  41.12 
 
 
1001 aa  569  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  39.19 
 
 
1016 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  37.42 
 
 
1043 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  36.34 
 
 
1052 aa  482  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  37.17 
 
 
1049 aa  479  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  37.51 
 
 
1049 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  36.79 
 
 
1052 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  36.69 
 
 
1052 aa  466  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  36.77 
 
 
1053 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  39.26 
 
 
1018 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  37.62 
 
 
1049 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  38.25 
 
 
1042 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  38.87 
 
 
1015 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  37.54 
 
 
1048 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.44 
 
 
1048 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.37 
 
 
1042 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  35.88 
 
 
1045 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  35.42 
 
 
1064 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  35.85 
 
 
1047 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  35.81 
 
 
1059 aa  442  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  35.74 
 
 
1047 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  36.53 
 
 
991 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  34.03 
 
 
1076 aa  432  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  34.93 
 
 
1064 aa  429  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  36.71 
 
 
1054 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  36.98 
 
 
1014 aa  426  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  33.8 
 
 
1062 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  35.83 
 
 
1000 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  36.75 
 
 
997 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  36.87 
 
 
997 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  31.33 
 
 
1047 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  36.82 
 
 
1037 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  36.46 
 
 
1040 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  34.72 
 
 
977 aa  386  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.68 
 
 
993 aa  353  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  33.04 
 
 
986 aa  352  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.35 
 
 
988 aa  342  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  35.02 
 
 
991 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  32.88 
 
 
980 aa  306  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  35.26 
 
 
959 aa  300  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.43 
 
 
911 aa  157  7e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.79 
 
 
890 aa  137  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.55 
 
 
914 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.62 
 
 
958 aa  69.3  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  22.29 
 
 
911 aa  69.3  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27 
 
 
962 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.73 
 
 
947 aa  65.1  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.79 
 
 
957 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  25.91 
 
 
951 aa  54.7  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.14 
 
 
836 aa  54.7  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.07 
 
 
781 aa  54.7  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  22.68 
 
 
997 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27 
 
 
908 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.49 
 
 
779 aa  51.6  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.12 
 
 
1000 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  27.57 
 
 
915 aa  50.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.25 
 
 
984 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.74 
 
 
915 aa  48.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 
1016 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  23.24 
 
 
909 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 
1099 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  27.47 
 
 
1100 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  26.25 
 
 
976 aa  47  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.1 
 
 
951 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.63 
 
 
913 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.94 
 
 
919 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.01 
 
 
957 aa  45.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>