More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4851 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  100 
 
 
239 aa  470  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  51.72 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  52.59 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  52.16 
 
 
248 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  50 
 
 
240 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  54.46 
 
 
237 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  50.43 
 
 
248 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  50.86 
 
 
248 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  50.86 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  49.36 
 
 
240 aa  223  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  50.64 
 
 
250 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  49.37 
 
 
245 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  50.43 
 
 
236 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  49.57 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  49.57 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  47.46 
 
 
250 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  49.78 
 
 
240 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  50.65 
 
 
255 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 
241 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  47.64 
 
 
252 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  48.09 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  45.49 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  43.22 
 
 
240 aa  191  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  42.13 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  43.28 
 
 
252 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  41.77 
 
 
252 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  43.22 
 
 
243 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  41.25 
 
 
239 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  43.11 
 
 
243 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
227 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  41.2 
 
 
232 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  40.34 
 
 
243 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  37.82 
 
 
243 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  38.56 
 
 
221 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  39.92 
 
 
223 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.98 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  37.45 
 
 
221 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  39.22 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 
230 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 
223 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  32.33 
 
 
220 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  32.33 
 
 
220 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 
239 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  35.69 
 
 
248 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
236 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
223 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
232 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  36 
 
 
228 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  35.86 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 
240 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 
221 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.36 
 
 
219 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
228 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  35.66 
 
 
229 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  35.66 
 
 
229 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 
240 aa  101  9e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 
249 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  31.36 
 
 
219 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 
229 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  37.34 
 
 
243 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  37.13 
 
 
222 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
223 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
241 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
240 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
240 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  35.93 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
240 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  35.27 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  35.27 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  35.27 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  35.27 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 
223 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
242 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
225 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  35.81 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  36.91 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  34.31 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  35.17 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  36.02 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  35.04 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  36.93 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
225 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  35 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 
223 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.35 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
224 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>