More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4798 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 248 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.14 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.63 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  31.3 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  37.05 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  30.89 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  31.19 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  30.35 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  27.17 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0324454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  27.67 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  28.63 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0665  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.5 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.719138  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.98 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  28.63 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  28.16 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  26.26 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.64 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  25.4 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>