189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4624 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  100 
 
 
510 aa  985    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  39.58 
 
 
511 aa  263  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  37.98 
 
 
513 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  39.54 
 
 
512 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  38.86 
 
 
512 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  39.16 
 
 
512 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  39.62 
 
 
514 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  39.19 
 
 
511 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  36.71 
 
 
490 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  36.35 
 
 
543 aa  210  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  39.92 
 
 
505 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  33.26 
 
 
596 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  37.07 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  33.68 
 
 
508 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  33.81 
 
 
508 aa  183  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  34.09 
 
 
508 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  35.39 
 
 
520 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  32.73 
 
 
510 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.66 
 
 
494 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.77 
 
 
519 aa  153  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  32.02 
 
 
499 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  30.33 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  33.67 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.12 
 
 
487 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  29.17 
 
 
504 aa  136  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  34.33 
 
 
329 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  31.01 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  36.84 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.56 
 
 
318 aa  123  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  40.67 
 
 
529 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  26.3 
 
 
505 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  31.45 
 
 
498 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  40.51 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  32.6 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  36.53 
 
 
321 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  31.36 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  31.01 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  31.01 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  38.94 
 
 
495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  31.91 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  35.23 
 
 
328 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  36.5 
 
 
508 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  34.43 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.12 
 
 
519 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  33.68 
 
 
509 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  37.76 
 
 
286 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  32.68 
 
 
508 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.38 
 
 
512 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  40.78 
 
 
433 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  31.71 
 
 
500 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  35.62 
 
 
445 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  36.77 
 
 
435 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  40.29 
 
 
433 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  40.29 
 
 
433 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  40.29 
 
 
433 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  40.29 
 
 
433 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  40.29 
 
 
433 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  37.91 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  37.91 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  37.91 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  37.91 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  39.81 
 
 
433 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  36.06 
 
 
443 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  32.41 
 
 
500 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  34.5 
 
 
503 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  39.81 
 
 
433 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  40.89 
 
 
211 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  39.81 
 
 
433 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  33.64 
 
 
315 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  34.5 
 
 
503 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  35.15 
 
 
502 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  35.75 
 
 
443 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  37.91 
 
 
433 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.61 
 
 
540 aa  99.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  34 
 
 
503 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  36.04 
 
 
518 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  39.05 
 
 
443 aa  98.6  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  42.93 
 
 
291 aa  97.8  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  38.94 
 
 
208 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  32.5 
 
 
503 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  27.56 
 
 
489 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  27.56 
 
 
489 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  39.51 
 
 
208 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  32.86 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  36.82 
 
 
511 aa  95.1  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  30 
 
 
313 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  31.82 
 
 
347 aa  93.2  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  32.22 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  30.14 
 
 
495 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  42.69 
 
 
215 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  42.54 
 
 
213 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  42.69 
 
 
215 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  33.17 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  34.86 
 
 
518 aa  89  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  30.29 
 
 
510 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  38.39 
 
 
321 aa  86.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  41.44 
 
 
213 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  41.44 
 
 
213 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  41.44 
 
 
213 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  41.44 
 
 
213 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>