104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4402 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  284  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  70.54 
 
 
129 aa  194  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  66.18 
 
 
137 aa  193  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  65.38 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  64 
 
 
144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  59.84 
 
 
136 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  60.29 
 
 
169 aa  156  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  59.69 
 
 
144 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  59.4 
 
 
145 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  56.62 
 
 
146 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  59.54 
 
 
136 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  57.35 
 
 
139 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  57.36 
 
 
166 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  57.25 
 
 
142 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  57.35 
 
 
139 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  57.35 
 
 
139 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 
134 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  57.66 
 
 
139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  61.11 
 
 
141 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  58.09 
 
 
139 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  56.93 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  60.61 
 
 
155 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  60.61 
 
 
155 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  60.61 
 
 
155 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  60.61 
 
 
155 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  60.61 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  60.61 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  59.85 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  47.97 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  46.61 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 
241 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  35.65 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
253 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  30.17 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  30.17 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
226 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  34.94 
 
 
112 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
215 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  33.33 
 
 
215 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
221 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
221 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  35.37 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
227 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
124 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 
124 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  28.91 
 
 
480 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
222 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.46 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  34.55 
 
 
223 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
227 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 
226 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
224 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
219 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.37 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 
533 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  31.13 
 
 
477 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.34 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  28.09 
 
 
184 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
223 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
252 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  29.66 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 
271 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>