More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4232 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  58.73 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  42.31 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  42.01 
 
 
196 aa  147  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  40.11 
 
 
190 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  47.93 
 
 
185 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  36.31 
 
 
185 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  37.91 
 
 
202 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  39.13 
 
 
194 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  36.09 
 
 
191 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  34.39 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.83 
 
 
184 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  33.89 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  35.33 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  34.76 
 
 
189 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  32.22 
 
 
183 aa  105  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  37.43 
 
 
196 aa  101  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  32.94 
 
 
163 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  32.97 
 
 
188 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  34.21 
 
 
189 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  32.16 
 
 
188 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.72 
 
 
174 aa  98.6  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.56 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.04 
 
 
170 aa  95.5  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.68 
 
 
194 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.7 
 
 
174 aa  95.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.15 
 
 
169 aa  94.7  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.87 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.49 
 
 
165 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  34.41 
 
 
178 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.43 
 
 
169 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.39 
 
 
186 aa  91.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.61 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.61 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.18 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.48 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  33.14 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  34.03 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.64 
 
 
186 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.28 
 
 
176 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.24 
 
 
176 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  28.48 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.29 
 
 
184 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.12 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.89 
 
 
169 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.81 
 
 
178 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.53 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.12 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.56 
 
 
169 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  36.26 
 
 
184 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.21 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  30.58 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.24 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.05 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  35.53 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.8 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.9 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.22 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.57 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  31.22 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.07 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.98 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.11 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.96 
 
 
174 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.08 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.27 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  30.37 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.27 
 
 
166 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  34.39 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  34.39 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.39 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.86 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.27 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  34.39 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  35.03 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  34.39 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  34.39 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  32.21 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.25 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.04 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.65 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.49 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  32.35 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.75 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.83 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  31.06 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  34.39 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  26.8 
 
 
329 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  33.76 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28.57 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.55 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.22 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.32 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.02 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.5 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.16 
 
 
166 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.67 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.11 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>