More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4157 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  100 
 
 
432 aa  874  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  53.83 
 
 
452 aa  441  1e-122  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  51.04 
 
 
451 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  51.74 
 
 
451 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  51.72 
 
 
451 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  51.2 
 
 
452 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  48.4 
 
 
429 aa  342  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  40.38 
 
 
420 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  38.69 
 
 
463 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  38.08 
 
 
422 aa  245  1e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  37.35 
 
 
430 aa  226  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  36.41 
 
 
393 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  37.28 
 
 
384 aa  213  5e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  38 
 
 
397 aa  213  5e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  36.05 
 
 
384 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  36.03 
 
 
411 aa  206  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  34.56 
 
 
388 aa  176  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  32.84 
 
 
400 aa  162  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  33.33 
 
 
500 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  30.73 
 
 
444 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  30.68 
 
 
434 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  28.75 
 
 
467 aa  140  4e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  28.22 
 
 
400 aa  135  2e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  38.1 
 
 
242 aa  133  7e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  28.22 
 
 
399 aa  131  2e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  27.56 
 
 
399 aa  128  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.01 
 
 
400 aa  127  4e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.01 
 
 
400 aa  127  4e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  27.01 
 
 
399 aa  127  4e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  27.98 
 
 
400 aa  126  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  27.78 
 
 
401 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  27.98 
 
 
415 aa  122  1e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  27.98 
 
 
415 aa  122  1e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  27.98 
 
 
399 aa  122  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  27.74 
 
 
399 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  27.45 
 
 
401 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.88668e-10  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  27.45 
 
 
401 aa  113  7e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  27.08 
 
 
400 aa  112  1e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  28.99 
 
 
412 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.16 
 
 
424 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.32 
 
 
400 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.9 
 
 
402 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.3 
 
 
387 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  28.54 
 
 
451 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.82 
 
 
410 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.51 
 
 
412 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.22 
 
 
482 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  28.29 
 
 
451 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.68 
 
 
379 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  28.86 
 
 
451 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  31.7 
 
 
415 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.24 
 
 
396 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 
456 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.32 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  28.62 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.08 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.48 
 
 
376 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.84 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.23 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  37.04 
 
 
181 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.18 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  42.61 
 
 
137 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.65 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  24.64 
 
 
439 aa  85.9  1e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.41 
 
 
433 aa  85.1  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25.59 
 
 
413 aa  83.6  6e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.35 
 
 
400 aa  82.8  1e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  26.48 
 
 
393 aa  82.4  1e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.94 
 
 
401 aa  81.6  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.32 
 
 
367 aa  82  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.91 
 
 
413 aa  81.6  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.65 
 
 
414 aa  82  2e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  23.19 
 
 
452 aa  81.3  3e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.78 
 
 
412 aa  80.9  4e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.37 
 
 
414 aa  80.5  5e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.76 
 
 
443 aa  80.5  6e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25.45 
 
 
448 aa  79.7  9e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.58 
 
 
410 aa  78.6  2e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.6 
 
 
407 aa  78.6  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.25 
 
 
414 aa  79  2e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.41 
 
 
404 aa  78.2  3e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  26.03 
 
 
423 aa  77.8  3e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  31.05 
 
 
413 aa  77.8  4e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.76 
 
 
449 aa  77.8  4e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.21 
 
 
403 aa  77  5e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.26 
 
 
402 aa  77  5e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.84 
 
 
413 aa  77  7e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  26.91 
 
 
486 aa  76.6  8e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.74 
 
 
421 aa  75.9  1e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.06 
 
 
389 aa  75.9  1e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.97 
 
 
426 aa  75.9  2e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  23.59 
 
 
408 aa  74.3  3e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.78 
 
 
282 aa  73.9  5e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.89 
 
 
409 aa  73.6  7e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.95 
 
 
337 aa  72.8  1e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.59 
 
 
374 aa  72.8  1e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.74 
 
 
395 aa  72.8  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  28.37 
 
 
400 aa  72.8  1e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  22.85 
 
 
439 aa  73.2  1e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.08 
 
 
374 aa  72.4  2e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>