198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4107 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1098    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  54.23 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  49.27 
 
 		 554 aa  521  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  42.94 
 
 		 553 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  41.04 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.83 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.13 
 
 		 585 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  37.68 
 
 		 607 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  39.17 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.26 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  38.27 
 
 		 545 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  38.36 
 
 		 556 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.81 
 
 		 569 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  34.07 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.33 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.8 
 
 		 567 aa  230  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.74 
 
 		 578 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  30.22 
 
 		 567 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  30.22 
 
 		 567 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  30.22 
 
 		 567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.89 
 
 		 592 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.55 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  29.97 
 
 		 576 aa  202  9e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  32.99 
 
 		 575 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.46 
 
 		 571 aa  189  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.25 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  28.97 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.32 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  32.3 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.79 
 
 		 692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.48 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.32 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 596 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  28.97 
 
 		 581 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.33 
 
 		 747 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  27.73 
 
 		 568 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.73 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  25.64 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.6 
 
 		 559 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.25 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  26.97 
 
 		 597 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.39 
 
 		 692 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.39 
 
 		 592 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  27.52 
 
 		 558 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.34 
 
 		 561 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.03 
 
 		 549 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.37 
 
 		 546 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  25.79 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  23.63 
 
 		 551 aa  98.2  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  23.63 
 
 		 551 aa  98.2  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.16 
 
 		 560 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.98 
 
 		 585 aa  96.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.91 
 
 		 588 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.01 
 
 		 558 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.69 
 
 		 585 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  24.65 
 
 		 585 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.4 
 
 		 558 aa  94  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  27.77 
 
 		 607 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.46 
 
 		 595 aa  94  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 584 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.21 
 
 		 599 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.33 
 
 		 543 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  25.4 
 
 		 565 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.35 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.35 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24.29 
 
 		 557 aa  87.4  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.15 
 
 		 548 aa  87.4  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  30.03 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  29.68 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  24.07 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.61 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  25.32 
 
 		 558 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  25.81 
 
 		 587 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.17 
 
 		 573 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.21 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.46 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.49 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.62 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.73 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.8 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.32 
 
 		 610 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  24.32 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  24.27 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.98 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  22.83 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  23.49 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  22.83 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  22.83 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  22.83 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.16 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  24.44 
 
 		 602 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.89 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.16 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  22.62 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.16 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  22.62 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  24.09 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  22.62 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.93 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>