More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4054 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
364 aa  714    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  54.04 
 
 
345 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  50.46 
 
 
348 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.66 
 
 
339 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.76 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.72 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.68 
 
 
319 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.24 
 
 
318 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.15 
 
 
351 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  49.68 
 
 
347 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  43.55 
 
 
318 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  41.98 
 
 
351 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  45.62 
 
 
347 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  43.32 
 
 
308 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  45.76 
 
 
341 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  45.74 
 
 
347 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  47.21 
 
 
323 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.44 
 
 
476 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 
384 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  43.66 
 
 
462 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.8 
 
 
476 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.14 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.7 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.62 
 
 
381 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  39.47 
 
 
389 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.75 
 
 
471 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.2 
 
 
472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  36.67 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.64 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.31 
 
 
476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  42.65 
 
 
464 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  43.9 
 
 
500 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.9 
 
 
387 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.91 
 
 
481 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.37 
 
 
453 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  40.14 
 
 
495 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  42.66 
 
 
545 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.39 
 
 
303 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.44 
 
 
475 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.45 
 
 
461 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  40.46 
 
 
488 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  42.01 
 
 
369 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.18 
 
 
479 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  40.77 
 
 
487 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.42 
 
 
478 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.65 
 
 
466 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  39.53 
 
 
391 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.91 
 
 
485 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  36.23 
 
 
498 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  38.64 
 
 
464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.08 
 
 
482 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  38.91 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.62 
 
 
453 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  39.78 
 
 
493 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.73 
 
 
343 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  39.78 
 
 
506 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  39.44 
 
 
511 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.46 
 
 
452 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 
480 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  38.29 
 
 
375 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.81 
 
 
388 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  43.41 
 
 
525 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.44 
 
 
482 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40 
 
 
476 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  37.39 
 
 
408 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.58 
 
 
428 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.39 
 
 
408 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  38.84 
 
 
392 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  36.56 
 
 
415 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  35.86 
 
 
418 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.07 
 
 
479 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 
484 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.07 
 
 
380 aa  185  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.05 
 
 
469 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.91 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.39 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  38.83 
 
 
528 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.88 
 
 
474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.71 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.07 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  37.14 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.07 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.34 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.54 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.55 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.93 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.63 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  37.91 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  37.69 
 
 
473 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40 
 
 
481 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.58 
 
 
401 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  43.35 
 
 
500 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.28 
 
 
317 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 
481 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  39.19 
 
 
514 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.53 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.6 
 
 
476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>