More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4025 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4025  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 383 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.259915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1335  RND family efflux transporter MFP subunit  73.53 
 
 		 385 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.92 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  57.18 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.45 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.73 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  60.44 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.14 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  53.73 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  58.29 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  58.66 
 
 		 381 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.23 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  55.04 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  59.82 
 
 		 409 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  56.38 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  55.85 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.41 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  56.82 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  57.1 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  57.68 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  52.85 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  60.67 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  51.46 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3843  RND family efflux transporter MFP subunit  59.37 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.7 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  51.19 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.19 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  53.44 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  52.89 
 
 		 386 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  54.45 
 
 		 409 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  56.21 
 
 		 384 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  54.45 
 
 		 409 aa  355  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  53.08 
 
 		 382 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  54.52 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  54.52 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  55.86 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  54.19 
 
 		 409 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  54.52 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  58.24 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  52.62 
 
 		 386 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  54.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  54.6 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  54.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  59 
 
 		 412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  54.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  54.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  51.85 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  54.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  53.01 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.4 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.7 
 
 		 411 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  52.77 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  51.78 
 
 		 431 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  50.27 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  51.97 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  51.97 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  51.85 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  52.27 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  53.39 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  52.53 
 
 		 385 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  54.84 
 
 		 384 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  51.06 
 
 		 381 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  52.53 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  50 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.73 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.87 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.42 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  54.73 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.27 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  52.27 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  52.27 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  52.27 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  53.54 
 
 		 425 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  52 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  52 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  54.11 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.15 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.4 
 
 		 397 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  52.15 
 
 		 386 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  55.94 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  51.6 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  58.65 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  58.65 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  58.65 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  58.65 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  58.65 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  48.64 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  54.22 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  54.89 
 
 		 386 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  53.1 
 
 		 385 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  53.1 
 
 		 385 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  53.1 
 
 		 385 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  51.74 
 
 		 394 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  54.07 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  51.25 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  53.33 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  54.07 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  51.35 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.81 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>