More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4005 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 437 aa  896    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  61.14 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  44.52 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  44.74 
 
 		 447 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  45.61 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  44.8 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  43.55 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  40.39 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  42.86 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  31.7 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  32.57 
 
 		 431 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  29.47 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  33.11 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  31.96 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  29.32 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  31.17 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  27.4 
 
 		 471 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.45 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  26.9 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  31.91 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  26.68 
 
 		 446 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  26.68 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  29.53 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  30.86 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  30.26 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  27.06 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  27.61 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  28.2 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  29.57 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  30.7 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  26.05 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  28.12 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  30.09 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  29.66 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  30.26 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  27.39 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  29.55 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  29.11 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  29.23 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  25.75 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  25.81 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  28.48 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  30.17 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  31.36 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  25.81 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  31.12 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.06 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  30.89 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  25.54 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.14 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.45 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  29.44 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  30 
 
 		 488 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  27.9 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  29.77 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  26.5 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  30.48 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  26.11 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  26.71 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  26.33 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  28.66 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 470 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  28.02 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  28.97 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  27.22 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  26.2 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  26.62 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  28.69 
 
 		 486 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  24.49 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  29.31 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.02 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  27.78 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  27.73 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  25.39 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  28.6 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  28.6 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  27.63 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  29.42 
 
 		 489 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  25.89 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  25.28 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  26.17 
 
 		 909 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  28.38 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  29.02 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  28.01 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  30.68 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  28.45 
 
 		 467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  28.72 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  27.71 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  26.68 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  28.33 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  26.75 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>