More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3932 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 		 190 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  43.24 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  35.29 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  34.71 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  35.29 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 192 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  84.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 600 aa  82  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 211 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  28.47 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  23.37 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 213 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  27.2 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  29.1 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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