85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3906 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 141 aa  293  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  63.64 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  58.06 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  57.14 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.31 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  53.23 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  50.79 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  46.27 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  52.38 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  52.46 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  53.97 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  53.97 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  44.62 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.77 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.31 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.62 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  45.31 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  52.38 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.91 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  43.55 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  42.86 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  46.88 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  46.97 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  45.9 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  48.48 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  42.19 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  39.34 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  41.54 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  42.62 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  46.03 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  35.94 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  42.19 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  44.62 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  42.37 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  41.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  42.19 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  35.94 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  44 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  42.62 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.1 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  36.51 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  41.54 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.7 
 
 		 99 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  35.29 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0838  type I restriction-modification system, R subunit  38.1 
 
 		 1210 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.82 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  35.38 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>