146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3836 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 411 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  77.43 
 
 		 401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  75.97 
 
 		 401 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  71.36 
 
 		 421 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  72.75 
 
 		 418 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  73.43 
 
 		 399 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  69.1 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  69.27 
 
 		 394 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  69.27 
 
 		 394 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  74.94 
 
 		 399 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  68.59 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  69.03 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  69.19 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  70.18 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  65.62 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  64.01 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  68.93 
 
 		 373 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  65.28 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  60.64 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  58.72 
 
 		 402 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  59.5 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  58.46 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  59.18 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  56.7 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  57.49 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  56.3 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  59.53 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  55.47 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  51.41 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  53.25 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  52.21 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  50.5 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  44.18 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  47.33 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  43.72 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  44.15 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  43.3 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  44.08 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  43.06 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  43.84 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  42.86 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  43.17 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  43.54 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  43.78 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  44.31 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  41.81 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  42.96 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  43.47 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  41.51 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  42.53 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  40.1 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  42.23 
 
 		 412 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  40.72 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  40.3 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  40.21 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  37.64 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  48.2 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  33.5 
 
 		 410 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  45 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.31 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  37.98 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  40.16 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  39.29 
 
 		 430 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  40.18 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  39.73 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  38.64 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  36.16 
 
 		 459 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  36.68 
 
 		 466 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  39.29 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  38.36 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  39.29 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  39.29 
 
 		 472 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  38.43 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  34.71 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  41.24 
 
 		 190 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  33.64 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  32.7 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  80 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  37.5 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  36.92 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  34.44 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  29.91 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  34.44 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  36.92 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  33.87 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  34.04 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  35.14 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  35.11 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  35.64 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  34.09 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  35.16 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.9 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  33.03 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  37.29 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.04 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  31.13 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  34.9 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  33.85 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.55 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>