More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3794 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  57.38 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  55.79 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  58.05 
 
 		 238 aa  206  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  54.55 
 
 		 242 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  55.11 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  55.06 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  55.19 
 
 		 242 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  52.91 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  57.53 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  57.47 
 
 		 251 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  58.62 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  59.2 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  53.98 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  56.47 
 
 		 254 aa  197  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  56.32 
 
 		 241 aa  194  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  54.24 
 
 		 278 aa  194  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  52.43 
 
 		 275 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  53.14 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  55.88 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  58.52 
 
 		 248 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  54.02 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  54.12 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  54.12 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  56.82 
 
 		 250 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  56.47 
 
 		 263 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  50.86 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  54.02 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  55.68 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  51.72 
 
 		 265 aa  188  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  55.68 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  52.87 
 
 		 249 aa  185  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  52.87 
 
 		 246 aa  185  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  52.87 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  54.02 
 
 		 243 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  56.47 
 
 		 261 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  46.7 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  47.96 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 255 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  53.18 
 
 		 253 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  39.89 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  40.23 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  49.4 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  46.78 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  41.62 
 
 		 228 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  41.95 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  36.26 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 253 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  35.09 
 
 		 271 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  34.66 
 
 		 275 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  39.31 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  33.7 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  59.3 
 
 		 138 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  33.72 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  46.34 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  36.76 
 
 		 244 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0793  DNA repair protein RadC  55.43 
 
 		 128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  38.24 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  36.47 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 225 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  42.31 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  36.72 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  36.05 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  37.58 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  35.88 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  39.64 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  36.9 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  39.05 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  38.32 
 
 		 232 aa  104  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  34.52 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 259 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  36.47 
 
 		 224 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  37.06 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  35.12 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  36.09 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  36.69 
 
 		 224 aa  98.6  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  36.47 
 
 		 224 aa  98.2  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  36.31 
 
 		 222 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 214 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  34.94 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>