115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3758 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  477  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  33.73 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  33.79 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  31.38 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  30.88 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  35.1 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  31.38 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  31.38 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  31.38 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.74 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  34.39 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  32.84 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  29.89 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  31.08 
 
 
310 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  32.11 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.98 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  29.91 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  30.11 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  29.31 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  29.78 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  30.32 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  32.47 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  30.81 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  27.3 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  30.61 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  27.01 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  30.13 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  43.04 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  41.07 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  36.67 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  27.8 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  29.11 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  26.86 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  30.64 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  33.89 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  31.46 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  30.99 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  31.61 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  30.81 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  29.21 
 
 
280 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  29.01 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  28.96 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  31.29 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  29.87 
 
 
319 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  29.8 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  35.25 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  29.61 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  26.98 
 
 
323 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  30.48 
 
 
268 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.64 
 
 
234 aa  62  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  29.58 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  29.25 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  27.96 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  28.44 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  35.14 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  37.7 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  26.64 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  30.23 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  26.47 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  31.49 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  35.25 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  28.77 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  29.15 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  28.3 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  30.98 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  30.13 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.81 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  32 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  26.61 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  26.89 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  32.98 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  37.39 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  36.28 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  27.17 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  28.95 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  28.71 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  35.78 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  29.15 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  28.19 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  28.64 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  28.99 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  28.17 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  28.99 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  28.99 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  34.21 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  35.2 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  27.57 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  28.12 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>