38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3733 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 596 aa  1122    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  25.96 
 
 		 581 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  25.49 
 
 		 651 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  26.51 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.08 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  32.48 
 
 		 747 aa  67.4  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  22.77 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  26.41 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  27.53 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  24.12 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  32.58 
 
 		 640 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.65 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  26.43 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  31.58 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.67 
 
 		 589 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  27.96 
 
 		 2906 aa  60.5  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.07 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  27.18 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  41.41 
 
 		 2397 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  28.25 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  27.83 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  21.24 
 
 		 632 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  35.87 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  25.47 
 
 		 322 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  29.01 
 
 		 631 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  28.21 
 
 		 467 aa  54.7  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  30.4 
 
 		 649 aa  54.7  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  23.06 
 
 		 598 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.69 
 
 		 397 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  26.11 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  37.68 
 
 		 331 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  28.03 
 
 		 762 aa  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  26.9 
 
 		 529 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  25.57 
 
 		 330 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  23.45 
 
 		 524 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  31.71 
 
 		 447 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.74 
 
 		 1049 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>