177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3711 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 315 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  63.17 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  52.08 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  50 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  48.89 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  46.5 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  47.94 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  44.3 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  43.4 
 
 		 321 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  43.4 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  42.22 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  42.99 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  38.53 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  39.14 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  38.84 
 
 		 438 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  38.08 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  35.06 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  34.69 
 
 		 359 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  36.62 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  36.36 
 
 		 381 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  34.01 
 
 		 343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  33.14 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.96 
 
 		 481 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  34.82 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.81 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  32.7 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  30.07 
 
 		 479 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  33.43 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  29.83 
 
 		 479 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  37.19 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 791 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  36.16 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 777 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.9 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  35.49 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  33.61 
 
 		 443 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 791 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  35.45 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 		 454 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.79 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  33.12 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  33 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  35.74 
 
 		 418 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.68 
 
 		 491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.22 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  36.12 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  36.12 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  35.45 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  34.21 
 
 		 456 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.22 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 791 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  30.27 
 
 		 413 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  34.07 
 
 		 412 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.12 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.12 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  34.9 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.85 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 844 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 810 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  29.38 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 483 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  31.08 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  29.26 
 
 		 498 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.11 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  33.77 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  39.21 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  38.14 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  37.07 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  36.06 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  33.05 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  36.06 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  36.06 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  34.66 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  34.23 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  33 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  31.44 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  37.28 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.01 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.92 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  33.33 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  32.75 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  31.1 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  37.39 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  32.28 
 
 		 479 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  36.8 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.21 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  35.09 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  32.63 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  31.14 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>