191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3398 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1227    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  54.61 
 
 
614 aa  622  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  47.31 
 
 
605 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  43.55 
 
 
609 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  43.51 
 
 
604 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.38 
 
 
628 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  37.31 
 
 
621 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  36.45 
 
 
635 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  36.23 
 
 
635 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  36.23 
 
 
635 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  35.56 
 
 
636 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  34.75 
 
 
630 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  40.41 
 
 
639 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.2 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  38.93 
 
 
614 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  39.09 
 
 
607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  39.09 
 
 
607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  39.09 
 
 
607 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  38.85 
 
 
617 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  38.65 
 
 
614 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  37.92 
 
 
611 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  38.65 
 
 
614 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  37.32 
 
 
608 aa  313  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  36.65 
 
 
614 aa  308  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.56 
 
 
622 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  32.42 
 
 
617 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  32.29 
 
 
615 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  32.1 
 
 
615 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.76 
 
 
617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  32.1 
 
 
615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.42 
 
 
614 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  31.72 
 
 
613 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  35.27 
 
 
628 aa  283  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  31.49 
 
 
616 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  31.49 
 
 
616 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  31.49 
 
 
616 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  31.31 
 
 
616 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  31.78 
 
 
615 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.51 
 
 
625 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.24 
 
 
602 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  31.02 
 
 
628 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  29.33 
 
 
613 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  32.18 
 
 
627 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  30.99 
 
 
618 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  32.52 
 
 
618 aa  263  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  34.4 
 
 
605 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  31.76 
 
 
624 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  31.29 
 
 
585 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  32.57 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  30.64 
 
 
625 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  32.22 
 
 
1283 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  38.5 
 
 
584 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  30.82 
 
 
594 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  30.03 
 
 
599 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  37.05 
 
 
629 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.29 
 
 
610 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  30.29 
 
 
591 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  27.91 
 
 
607 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.83 
 
 
605 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  29.79 
 
 
602 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  39.02 
 
 
608 aa  223  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  39.3 
 
 
608 aa  223  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  30.57 
 
 
619 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  37.47 
 
 
621 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  31.18 
 
 
601 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  28.5 
 
 
611 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  48.66 
 
 
227 aa  220  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  30.24 
 
 
603 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  29.89 
 
 
603 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  31.41 
 
 
601 aa  220  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  29.73 
 
 
603 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  27.96 
 
 
616 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  31.41 
 
 
601 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.91 
 
 
616 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  30.59 
 
 
601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  28.66 
 
 
603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.45 
 
 
599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.02 
 
 
610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  29.41 
 
 
603 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  31.54 
 
 
590 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.16 
 
 
609 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  33.7 
 
 
611 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  34.66 
 
 
619 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  212  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.81 
 
 
595 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  32.08 
 
 
609 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  32.08 
 
 
609 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  32.08 
 
 
609 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.7 
 
 
587 aa  210  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.3 
 
 
611 aa  209  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  26.59 
 
 
609 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  34.3 
 
 
609 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  27.33 
 
 
592 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.01 
 
 
609 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.3 
 
 
609 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  31.33 
 
 
583 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.72 
 
 
609 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  27.77 
 
 
609 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  29.39 
 
 
588 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  32.48 
 
 
610 aa  200  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>