More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3339 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  506  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  55.07 
 
 
252 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  51.17 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4324  ABC transporter-related protein  54.35 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1409  ABC transporter related  52.36 
 
 
242 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.773805  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  50.45 
 
 
245 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  46.41 
 
 
252 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  46.67 
 
 
232 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  45.81 
 
 
315 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.77 
 
 
242 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  43.44 
 
 
231 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
238 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  42.73 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  45.7 
 
 
230 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.69 
 
 
255 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.33 
 
 
277 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  43.18 
 
 
234 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
266 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
264 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
259 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  41.63 
 
 
249 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.44 
 
 
233 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  42.8 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  45.16 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.36 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
232 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  42.49 
 
 
241 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.53 
 
 
455 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.13 
 
 
230 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.12 
 
 
237 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  41.82 
 
 
232 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  40.72 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 
286 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  41.05 
 
 
240 aa  178  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.44 
 
 
237 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
255 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.44 
 
 
237 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  41.38 
 
 
246 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  42.04 
 
 
252 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
262 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
221 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  42.53 
 
 
255 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
247 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
232 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 
221 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  43.36 
 
 
445 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  42.86 
 
 
258 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
234 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
234 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  37.39 
 
 
229 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.86 
 
 
274 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  41.95 
 
 
244 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 
246 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  46.89 
 
 
272 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  42.15 
 
 
240 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 
248 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.22 
 
 
242 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
232 aa  175  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  42.06 
 
 
249 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
244 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  42.06 
 
 
244 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
234 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
234 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  40.91 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  41.91 
 
 
247 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
279 aa  175  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  39.11 
 
 
225 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  45.61 
 
 
258 aa  174  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  41.48 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  40.76 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  39.91 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  42.02 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  43.48 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  40.45 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.32 
 
 
225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  40.91 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  39.91 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
291 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
233 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  44.39 
 
 
230 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  40.85 
 
 
234 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  39.19 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  39.19 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>