More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3280 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 923 aa  1862    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 835 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  27.85 
 
 		 959 aa  307  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 866 aa  252  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 870 aa  250  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 786 aa  225  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 831 aa  214  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 864 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 798 aa  188  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 798 aa  188  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 798 aa  188  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 812 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 798 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 798 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  25.92 
 
 		 798 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 798 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 798 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 815 aa  141  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 879 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 836 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 875 aa  132  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 882 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 793 aa  128  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 798 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 757 aa  119  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 761 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 753 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 754 aa  115  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  31.42 
 
 		 756 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 838 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 812 aa  92.8  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.92 
 
 		 815 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  28.89 
 
 		 808 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.37 
 
 		 812 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 889 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 817 aa  82  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  26.6 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 833 aa  76.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 926 aa  75.5  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 829 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 847 aa  71.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  25.33 
 
 		 808 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 798 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  23.63 
 
 		 856 aa  70.5  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 824 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  27.42 
 
 		 799 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 690 aa  68.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 981 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  25.78 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 863 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.94 
 
 		 1186 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  28.85 
 
 		 851 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 828 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 814 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 803 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 973 aa  66.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  28.85 
 
 		 851 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 830 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 801 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 795 aa  65.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 831 aa  65.1  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  27.2 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 844 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  21.67 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 836 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 821 aa  64.3  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 815 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  21.43 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.18 
 
 		 861 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 797 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 821 aa  62  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 799 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.36 
 
 		 862 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 716 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  21 
 
 		 799 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.8 
 
 		 718 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.36 
 
 		 797 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 811 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  28.08 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  22.45 
 
 		 896 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  23.62 
 
 		 829 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>