216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3277 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  58.73 
 
 
995 aa  1135    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
974 aa  1988    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  36.25 
 
 
783 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  33.23 
 
 
791 aa  361  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  41.92 
 
 
969 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  40.55 
 
 
951 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 
944 aa  314  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.39 
 
 
973 aa  294  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  29.34 
 
 
806 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  31.59 
 
 
679 aa  247  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  31.59 
 
 
679 aa  247  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  31.59 
 
 
679 aa  247  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  31.59 
 
 
679 aa  247  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  31.4 
 
 
679 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 
679 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  30.95 
 
 
695 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  29.98 
 
 
661 aa  237  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  27.7 
 
 
668 aa  235  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 
699 aa  221  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.85 
 
 
690 aa  211  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  25.85 
 
 
801 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.04 
 
 
770 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.19 
 
 
840 aa  188  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.67 
 
 
760 aa  187  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 
836 aa  185  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  29.69 
 
 
765 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.41 
 
 
779 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.85 
 
 
765 aa  178  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.3 
 
 
1024 aa  177  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.16 
 
 
752 aa  174  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.39 
 
 
836 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.5 
 
 
803 aa  173  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 
695 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.23 
 
 
821 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.54 
 
 
839 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.59 
 
 
821 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25.96 
 
 
776 aa  165  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.13 
 
 
792 aa  164  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.37 
 
 
779 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.79 
 
 
804 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.58 
 
 
779 aa  161  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  25.28 
 
 
828 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  24.44 
 
 
777 aa  160  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  26.77 
 
 
712 aa  159  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.01 
 
 
764 aa  160  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  24.25 
 
 
779 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.9 
 
 
774 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  25.49 
 
 
775 aa  158  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  27.99 
 
 
757 aa  157  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  26.35 
 
 
687 aa  156  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  23.85 
 
 
764 aa  156  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.94 
 
 
768 aa  154  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.66 
 
 
795 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 
743 aa  153  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  25.84 
 
 
681 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  29.31 
 
 
799 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  25.16 
 
 
806 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.7 
 
 
797 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  23.16 
 
 
746 aa  147  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  23.5 
 
 
825 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.46 
 
 
794 aa  144  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.51 
 
 
685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.1 
 
 
788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  25.5 
 
 
772 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  25.94 
 
 
828 aa  143  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25.69 
 
 
785 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.47 
 
 
700 aa  142  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  25.5 
 
 
772 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  25.5 
 
 
772 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  25.5 
 
 
772 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.75 
 
 
816 aa  141  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  25.3 
 
 
772 aa  141  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  25.5 
 
 
772 aa  141  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  25.3 
 
 
772 aa  141  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  24.67 
 
 
777 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  25.5 
 
 
772 aa  140  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  25.7 
 
 
772 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.72 
 
 
772 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.79 
 
 
791 aa  138  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  25.1 
 
 
772 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  25.1 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  26.72 
 
 
806 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.9 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.23 
 
 
787 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.72 
 
 
775 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
806 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.11 
 
 
803 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  26.23 
 
 
794 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  23.36 
 
 
775 aa  135  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.11 
 
 
806 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  24.71 
 
 
771 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  25.4 
 
 
749 aa  135  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  25.1 
 
 
763 aa  134  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
778 aa  134  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 
799 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  24.17 
 
 
780 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.7 
 
 
772 aa  134  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.4 
 
 
788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  24.9 
 
 
772 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  25.84 
 
 
760 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>