186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3276 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 401 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  48.79 
 
 		 524 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 		 533 aa  342  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  48.64 
 
 		 509 aa  335  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  45.19 
 
 		 618 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  50.29 
 
 		 383 aa  318  9e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  43.69 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 535 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  35.17 
 
 		 679 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  41.83 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  41.83 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  42.46 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.69 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  40.23 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  40.64 
 
 		 315 aa  169  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31 
 
 		 1338 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  41.43 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  41.67 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  30.17 
 
 		 1186 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.82 
 
 		 712 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  41.04 
 
 		 311 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  31.14 
 
 		 450 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  37.5 
 
 		 302 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.41 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  36.51 
 
 		 487 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.76 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  34.72 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  30.97 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  33.6 
 
 		 330 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  33.06 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  26.29 
 
 		 667 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 		 644 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.85 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.97 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  28.85 
 
 		 326 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.86 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.43 
 
 		 330 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 		 501 aa  86.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.72 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.84 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  26.89 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  30.08 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.59 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.67 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.95 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.82 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  29.92 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  33.85 
 
 		 965 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  34.09 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.19 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  35.65 
 
 		 1164 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  33.08 
 
 		 928 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.13 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.89 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  26.79 
 
 		 1122 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.85 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  29.61 
 
 		 951 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  29.6 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  32.87 
 
 		 604 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  31.47 
 
 		 1015 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  34.23 
 
 		 912 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 		 746 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  42.17 
 
 		 837 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.67 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  30.43 
 
 		 629 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.18 
 
 		 1505 aa  59.7  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.72 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  31.3 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.76 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.48 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  32.6 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  24.23 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.59 
 
 		 577 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.48 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.48 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.77 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  39.13 
 
 		 630 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.11 
 
 		 519 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.92 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.17 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  32.32 
 
 		 536 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>