More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3243 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  46.93 
 
 		 764 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 785 aa  1590    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  44.91 
 
 		 767 aa  608  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 790 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 773 aa  565  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  41.07 
 
 		 809 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  40.6 
 
 		 779 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 784 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 795 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 863 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 822 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 810 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 777 aa  311  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 771 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 732 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 737 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 755 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 756 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 758 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 743 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 769 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 763 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 734 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 857 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 720 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 725 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 856 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 710 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 797 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 751 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 775 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 743 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 759 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 722 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 761 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 780 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 766 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 704 aa  200  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 726 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 758 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 767 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 785 aa  192  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 783 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 723 aa  190  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 803 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 736 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 779 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 809 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 802 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 772 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 713 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 764 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 773 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 761 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 741 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 782 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 		 747 aa  181  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 864 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 817 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 765 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 829 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 744 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 838 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 748 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 755 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 792 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 776 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 919 aa  177  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 774 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 784 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 733 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 784 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 789 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 717 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 808 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 728 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 808 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 734 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 774 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 786 aa  171  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 757 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 722 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 730 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 761 aa  167  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>