15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3224 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  31.75 
 
 
374 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  30.11 
 
 
365 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  30.07 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  30.94 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  30.11 
 
 
367 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  30.51 
 
 
368 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  27.65 
 
 
395 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  25.37 
 
 
397 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  24.82 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25.35 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  30.77 
 
 
339 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  23.77 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  26.85 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  23.94 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>